由于未能足够快地扩大新病例的基因组测序范围以跟踪变异病毒，世界在追踪新的 COVID-19 变种的出现方面严重落后。 艾滋病医疗保健基金会 (AHF) 呼吁各国合作并致力于实现对所有 COVID-5 病例中至少 19% 进行测序并在一周内持续报告结果的全球目标。
根据追踪 SARS-CoV-2 基因组测序的最大开放获取全球平台——全球禽流感数据共享倡议 (GISAID)，目前只有约 1.5% 的病例已完成测序并向 GISAID 报告。 虽然少数国家表现良好，例如澳大利亚和冰岛，分别对 58.6% 和 57% 的病例进行了测序，但大多数国家远低于 5%，包括许多发达工业化国家。 更糟糕的是，到达 GISAID 的大多数报告都严重过时了——平均而言，从数据收集开始，各国需要近 78 天的时间才能将其提交给 GISAID。 由于报告滞后超过 2.5 个月，如此陈旧的数据严重破坏了应对不断变化的病毒的努力。
“基因组测序至关重要，因为我们目前掌握的流行病学信息很可能存在显著的时间滞后——现有数据反映的是一个月前甚至更久以前的情况，”艾滋病健康基金会主席迈克尔·温斯坦表示。“例如，如果一种新的变异株现在正在牙买加、秘鲁或乌克兰出现，我们可能要到下个月才能知晓。这关乎全球卫生安全，美国可以通过加强国内基因组测序工作并帮助其他国家开展相关工作，在基因组测序领域发挥重要的领导作用。如果没有及时的全球基因组测序数据，我们就如同盲人摸象，仍在打昨天的仗。”
AHF 已开始通过迈阿密大学的全球公共卫生研究所资助基因组测序项目，以展示如何快速有效地推出此类模型。 自今年早些时候推出以来，该计划已扩展到迈阿密以外的地区。 为了响应基因组测序提案请求，AHF 收到了墨西哥、阿根廷、巴西、乌干达、肯尼亚、印度、特立尼达和多巴哥和泰国提交的材料，以及牙买加、菲律宾和乌克兰的意向书。
“我们资助基因组测序项目，是为了表明我们不仅在谈论这个问题并要求采取更多行动，而且还在付诸行动。艾滋病健康基金会（AHF）资助项目的一项要求是，数据必须与GISAID共享，以便世界各地的人们都能从中受益，”迈阿密大学AHF全球公共卫生研究所执行主任豪尔赫·萨维德拉博士说。
迈阿密大学著名病毒学家、AHF 资助获得者之一 Mario Stevenson 教授强调了追踪新出现的 SARS-CoV-2 变体作为了解敌人的一种方式的重要性。 “与敌人作战的最好方法是从内部了解敌人。 基因组测序使我们能够准确地了解冠状病毒如何变化，它可能如何进化和攻击，以及它是否是令人关注的变体或必须密切关注的感兴趣变体，”史蒂文森教授说。
